Програмне забезпечення Atlassian FishEye надає веб-інтерфейс для перегляду репозиторіїв Subversion, CVS та Perforce. Продукт дозволяє відстежувати зміни, отримувати повідомлення про них, генерувати запити і переглядати історію змін. FishEye також шукає вихідний код, шляхи, авторів та коментарі.

Atlassian FishEye надає повну інформацію про те, хто і коли вніс зміни до вихідного коду. Програма дозволяє експортувати дані в формати CSV і XML, а також надає спеціальний API для взаємодії з FishEye.

FishEye оснащений потужною пошуковою системою з гнучкими критеріями пошуку, включаючи версії збірок, авторів та інших.

Вбудована система аутентифікації дозволяє захистити вихідний код за допомогою облікових записів LDAP/Active Directory, аутентифікації AJP і різних плагінів для захисту.